Пакет: pynast (1.2.2-4)
Ссылки для pynast
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код pynast:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Steffen Moeller (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Tim Booth (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
alignment of short DNA sequences
The package provices a reimplementation of the Nearest Alignment Space Termination tool in Python. It was prepared for next generation sequencers.
Given a set of sequences and a template alignment, PyNAST will align the input sequences against the template alignment, and return a multiple sequence alignment which contains the same number of positions (or columns) as the template alignment. This facilitates the analysis of new sequences in the context of existing alignments, and additional data derived from existing alignments such as phylogenetic trees. Because any protein or nucleic acid sequences and template alignments can be provided, PyNAST is not limited to the analysis of 16s rDNA sequences.
Другие пакеты, относящиеся к pynast
|
|
|
|
-
- dep: libjs-jquery
- JavaScript library for dynamic web applications
-
- dep: libjs-underscore
- JavaScript's functional programming helper library
-
- dep: python
- интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7)
-
- rec: blast2
- пустой переходный пакет для ncbi-blash+-legacy
-
- rec: clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
-
- rec: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- rec: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- rec: python-mpi4py
- bindings of the Message Passing Interface (MPI) standard
-
- sug: uclust
- Пакет недоступен
Загрузка pynast
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
all | 79,7 Кб | 302,0 Кб | [список файлов] |