Paquet : clustalw (2.1+lgpl-6)
Liens pour clustalw
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source clustalw :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller (Page QA)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.clustal.org]
Paquets similaires :
alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
Ce programme réalise l'alignement de séquences multiples de nucléotides ou d'acides aminés. Il identifie le format des séquences en entrée et détermine s'il s'agit d'acides nucléiques (ADN/ARN) ou d'acides aminés (peptides). Le format en sortie peut être choisi parmi divers formats pour les alignements multiples, comme Phylip ou FASTA. Clustal W est largement reconnu.
Les données en sortie de Clustal W peuvent être modifiées manuellement ou avec un éditeur d'alignement comme Seaview ou le logiciel compagnon Clustal X. Lorsqu'un modèle est construit à partir des alignements, il peut être utilisé pour améliorer les recherches dans les bases de données. Celles-ci peuvent être créées sous forme de modèles de Markov (HMM) avec le paquet HMMER.
Autres paquets associés à clustalw
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- sug: clustalx
- alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
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- sug: seaview
- Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
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- enh: bioperl-run
- scripts d'enveloppe BioPerl
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- enh: emboss
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
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- enh: t-coffee
- alignement multiple de séquences
Télécharger clustalw
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 294,1 ko | 834,0 ko | [liste des fichiers] |