Paquet : artemis (17.0.1+dfsg-2)

[ Paquet source : artemis  ]

navigateur de génome et outil d'annotation

Artemis est un navigateur de génome et un outil d'annotation qui permet de visualiser des caractéristiques de séquence, des données de nouvelle génération et les résultats d'analyses dans le contexte de la séquence, et la traduction six-frame de la séquence.

Ce paquet fournit le navigateur de génome Artemis, l'outil de comparaison Artemis (ACT) et les outils DNAplotter et BamView.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::java, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Champ d'application: Utilitaire, But: Analyse, use::comparing, use::editing, Fonctionne avec: Séquence biologique, Système X Window: Application

Autres paquets associés à artemis

• dep: default-jre

  environnement d'exécution Java standard ou compatible

  ou java8-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre

  ou java9-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre

  ou java10-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre

  ou java11-runtime

  paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  exécution d'exécutables Java au format jar

• dep: jemboss

  interface graphique pour EMBOSS

• dep: libbatik-java

  bibliothèque SVG de xml.apache.org

• dep: libbiojava-java

  API Java pour des applications et des données biologiques –⋅version par défaut

• dep: libbiojava1.7-java

  API Java pour des applications et des données biologiques –⋅version⋅1.7

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang utility classes

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libibatis-java

  iBATIS Data Mapper framework

• dep: libj2ssh-java

  Java library for the SSH protocol

• dep: liblog4j1.2-java

  Logging library for java

• dep: libpicard-java

  Java library to manipulate SAM and BAM files

• dep: libpostgresql-jdbc-java

  Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 574,3 ko	11 312,0 ko	[liste des fichiers]