Paquet : libhtsjdk-java (2.18.2+dfsg-2)

[ Paquet source : htsjdk  ]

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

HTSJDK is an implementation of a unified Java library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map) and VCF, used for high-throughput sequencing data. There are also an number of useful utilities for manipulating HTS data.

Autres paquets associés à libhtsjdk-java

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  Apache Commons JEXL - Java Expression Language

• dep: libcommons-logging-java

  interface commune d'enveloppe pour plusieurs API de connexion

• dep: libjaxb-java

  implémentation de référence de JAXB

• dep: libngs-java

  liaisons du langage de séquençage de nouvelle génération –⋅liaisons Java

• dep: libsnappy-java

  Snappy for Java, a fast compressor/decompresser

• dep: libxz-java

  Java library with a complete implementation of XZ data compression

• sug: picard-tools

  outils en ligne de commande pour manipuler les fichiers SAM et BAM

• sug: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	1 464,1 ko	1 641,0 ko	[liste des fichiers]