Pakiet: artemis (17.0.1+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: artemis  ]

Program do przeglądania genomów i tworzenia adnotacji

Artemis to przeglądarka genomów i narzędzie do adnotacji, które umożliwia wizualizację cech sekwencji, danych nowej generacji i wyników analiz w kontekście tej sekwencji, a także jej translację w sześciu ramkach.

Pakiet zawiera program do przeglądania genomów Artemis, Artemis Comparison Tool (ACT) oraz narzędzia DNAplotter i BamView.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::java, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, use::editing, Działa z: Sekwencje biologiczne, X Window System: Aplikacja

Inne pakiety związane z artemis

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

  lub java8-runtime

  pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre

  lub java9-runtime

  pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre

  lub java10-runtime

  pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre

  lub java11-runtime

  pakiet wirtualny udostępniany przez default-jre, openjdk-11-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  Uruchamianie wykonywalnych plików *.jar Javy

• dep: jemboss

  graphical user interface to EMBOSS

• dep: libbatik-java

  xml.apache.org SVG Library

• dep: libbiojava-java

  Java API to biological data and applications (default version)

• dep: libbiojava1.7-java

  Java API to biological data and applications (version 1.7)

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang utility classes

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libibatis-java

  iBATIS Data Mapper framework

• dep: libj2ssh-java

  Java library for the SSH protocol

• dep: liblog4j1.2-java

  Logging library for java

• dep: libpicard-java

  Java library to manipulate SAM and BAM files

• dep: libpostgresql-jdbc-java

  Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

Pobieranie artemis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 574,3 KiB	11 312,0 KiB	[lista plików]