Paket: artemis (17.0.1+dfsg-2)

[ Quellcode: artemis  ]

Genombrowser und Anmerkungswerkzeug

Artemis ist ein Genombrowser und ein Anmerkungswerkzeug (annotation tool), mit dem Sequenzmerkmale, Daten der nächsten Generation und die Ergebnisse von Analysen im Kontext der Sequenz sowie deren »six-frames translation« visualisiert werden können.

Dieses Paket enthält den Artemis-Genombrowser, das Artemis Comparison Tool (ACT) sowie die Dienstprogramme DNAplotter und BamView.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::java, interface::commandline, Benutzer-Schnittstellen: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Analyse, use::comparing, use::editing, Arbeitet mit: Biologische Sequenz, X-Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu artemis

• dep: default-jre

  Standard-Java- oder Java-kompatible Laufzeitumgebung

  oder java8-runtime

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre

  oder java9-runtime

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre

  oder java10-runtime

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre

  oder java11-runtime

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre

• dep: jarwrapper (>= 0.5)

  Startet ausführbare Java-.jar-Dateien

• dep: jemboss

  Europäische Software-Suite für Molekularbiologie - grafische Oberfläche

• dep: libbatik-java

  SVG-Bibliothek von xml.apache.org

• dep: libbiojava-java

  Java API to biological data and applications (default version)

• dep: libbiojava1.7-java

  Java API to biological data and applications (version 1.7)

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang - Hilfsklassen

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libibatis-java

  iBATIS Data Mapper framework

• dep: libj2ssh-java

  Java library for the SSH protocol

• dep: liblog4j1.2-java

  Bibliothek zum Protokollieren für Java

• dep: libpicard-java

  Java-Bibliothek zur Bearbeitung von SAM- und BAM-Dateien

• dep: libpostgresql-jdbc-java

  Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.574,3 kB	11.312,0 kB	[Liste der Dateien]