Paquet : deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ Paquet source : deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Autres paquets associés à deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python

  langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)

• dep: python-dateutil

  extensions puissantes du module datetime standard de Python

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  gestion rapide des tableaux avec Python

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	19,9 ko	97,0 ko	[liste des fichiers]