Balík: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ Zdroj: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

• dep: python-dateutil

  mocné rozšírenia štandardného modulu datetime jazyka Python

• dep: python-h5py

  rozhranie k hdf5 na všeobecné účely pre Python 2

• dep: python-numpy

  Numerical Python pridáva schopnosti rýchlych polí do jazyka Python

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

Stiahnuť deepnano

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	19.9 kB	97.0 kB	[zoznam súborov]