Pakiet: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ Pakiet źródłowy: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Inne pakiety związane z deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

• dep: python-dateutil

  powerful extensions to the standard Python datetime module

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

Pobieranie deepnano

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	19,9 KiB	97,0 KiB	[lista plików]