Paquet : rampler (2.0.0-1)

[ Paquet source : rampler  ]

module d’échantillonnage de séquences génomiques

Il s’agit d’un module autonome pour l’échantillonnage de séquences génomiques. Il gère deux modes : sous-échantillonnage aléatoire de données de séquenceur jusqu’à la profondeur désirée (donnée par la longueur de référence) et le découpage de fichier jusqu’à la taille en octets désirée.

Rampler prend comme premier argument d’entrée un fichier au format FASTA/FASTQ pouvant être compressé avec gzip. La suite des paramètres d’entrée dépend du mode opératoire. La sortie est stockée dans un ou plusieurs fichiers qui sont du même format que le fichier d’entrée, mais non compressés.

Autres paquets associés à rampler

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger rampler

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	21,2 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	20,0 ko	60,0 ko	[liste des fichiers]
armel	19,6 ko	59,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	19,3 ko	47,0 ko	[liste des fichiers]
i386	22,8 ko	63,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	21,1 ko	70,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	21,0 ko	69,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	22,2 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	20,2 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]