Paquet : rampler (2.1.1-1 et autres)

[ Paquet source : rampler  ]

module d’échantillonnage de séquences génomiques

Il s’agit d’un module autonome pour l’échantillonnage de séquences génomiques. Il gère deux modes : sous-échantillonnage aléatoire de données de séquenceur jusqu’à la profondeur désirée (donnée par la longueur de référence) et le découpage de fichier jusqu’à la taille en octets désirée.

Rampler prend comme premier argument d’entrée un fichier au format FASTA/FASTQ pouvant être compressé avec gzip. La suite des paramètres d’entrée dépend du mode opératoire. La sortie est stockée dans un ou plusieurs fichiers qui sont du même format que le fichier d’entrée, mais non compressés.

Autres paquets associés à rampler

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [non arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger rampler

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.1.1-1	21,2 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.1.1-1	20,7 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1.1-1+b1	20,7 ko	85,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.1.1-1	19,2 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.1.1-1	18,9 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.1.1-1	22,7 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.1.1-1	22,0 ko	63,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.1.1-1	26,0 ko	96,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.1.1-1	20,4 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.1.1-1	20,5 ko	59,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.1.1-1	20,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.1.1-1	21,4 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1.1-1	21,5 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1.1-1+b1	21,8 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1.1-1	19,5 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.1.1-1	23,2 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.1.1-1	19,3 ko	1 046,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.1.1-1	20,7 ko	59,0 ko	[liste des fichiers]