Paquet : rampler (2.1.1-1)

[ Paquet source : rampler  ]

module for sampling genomic sequences

Standalone module for sampling genomic sequences. It supports two modes, random subsampling of sequencer data to a desired depth (given the reference length) and file splitting to desired size in bytes.

Rampler takes as first input argument a file in FASTA/FASTQ format which can be compressed with gzip. The rest of input parameters depend on the mode of operation. The output is stored into a file(s) which is in the same format as the input file but uncompressed.

Autres paquets associés à rampler

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger rampler

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	20,7 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	19,4 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
armel	19,2 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	18,9 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
i386	22,0 ko	63,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	20,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	20,8 ko	85,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	21,5 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	19,5 ko	64,0 ko	[liste des fichiers]