パッケージ: rampler (2.0.0-1)

[ ソース: rampler  ]

module for sampling genomic sequences

Standalone module for sampling genomic sequences. It supports two modes, random subsampling of sequencer data to a desired depth (given the reference length) and file splitting to desired size in bytes.

Rampler takes as first input argument a file in FASTA/FASTQ format which can be compressed with gzip. The rest of input parameters depend on the mode of operation. The output is stored into a file(s) which is in the same format as the input file but uncompressed.

その他の rampler 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, mipsel 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

rampler のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	21.2 kB	68.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	20.0 kB	60.0 kB	[ファイル一覧]
armel	19.6 kB	59.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	19.3 kB	47.0 kB	[ファイル一覧]
i386	22.8 kB	63.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	21.1 kB	70.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	21.0 kB	69.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	22.2 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	20.2 kB	64.0 kB	[ファイル一覧]