Paquet : daligner (1.0+git20180524.fd21879-1)

[ Paquet source : daligner  ]

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

Ces outils permettent de trouver tous les alignements locaux significatifs parmi des lectures encodées dans une base de données Dazzler. L’hypothèse est que les lectures sont originaires d’un séquenceur à lectures longues RS II de Pacific Biosciences. C'est-à-dire que les lectures sont longues et bruitées, jusqu’à 15 % en moyenne.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à daligner

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	176,9 ko	1 127,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	156,9 ko	1 137,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	147,2 ko	765,0 ko	[liste des fichiers]
i386	167,7 ko	1 265,0 ko	[liste des fichiers]