Paketti: trf (4.09.1-6 ja muut)
Links for trf
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti trf:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [tandem.bu.edu]
Samankaltaisia paketteja:
locate and display tandem repeats in DNA sequences
A tandem repeat in DNA is two or more adjacent, approximate copies of a pattern of nucleotides. Tandem Repeats Finder is a program to locate and display tandem repeats in DNA sequences. In order to use the program, the user submits a sequence in FASTA format. There is no need to specify the pattern, the size of the pattern or any other parameter. The output consists of two files: a repeat table file and an alignment file. The repeat table, viewable in a web browser, contains information about each repeat, including its location, size, number of copies and nucleotide content. Clicking on the location indices for one of the table entries opens a second browser page that shows an alignment of the copies against a consensus pattern. The program is very fast, analyzing sequences on the order of .5Mb in just a few seconds. Submitted sequences may be of arbitrary length. Repeats with pattern size in the range from 1 to 2000 bases are detected.
Muut pakettiin trf liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
Imuroi trf
| Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 56.9 kt | 183.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 4.09.1-6 | 56.9 kt | 167.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 4.09.1-6+b1 | 53.5 kt | 184.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armel | 4.09.1-6 | 55.4 kt | 182.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armhf | 4.09.1-6 | 53.0 kt | 182.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| hppa (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 54.3 kt | 159.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| i386 | 4.09.1-6 | 55.7 kt | 166.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ia64 (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 68.7 kt | 231.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| m68k (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 51.6 kt | 158.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 4.09.1-6 | 55.3 kt | 187.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64 (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 58.6 kt | 183.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 4.09.1-6 | 58.0 kt | 183.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 | 4.09.1-6+b1 | 55.4 kt | 148.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| s390x | 4.09.1-6 | 53.8 kt | 163.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sh4 (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 59.4 kt | 182.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sparc64 (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 53.6 kt | 1,080.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| x32 (epävirallinen siirros) | 4.09.1-6 | 54.8 kt | 154.0 kt | [tiedostoluettelo] |