Paket: trf (4.09.1-6 och andra)
Länkar för trf
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet trf:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [tandem.bu.edu]
Liknande paket:
locate and display tandem repeats in DNA sequences
A tandem repeat in DNA is two or more adjacent, approximate copies of a pattern of nucleotides. Tandem Repeats Finder is a program to locate and display tandem repeats in DNA sequences. In order to use the program, the user submits a sequence in FASTA format. There is no need to specify the pattern, the size of the pattern or any other parameter. The output consists of two files: a repeat table file and an alignment file. The repeat table, viewable in a web browser, contains information about each repeat, including its location, size, number of copies and nucleotide content. Clicking on the location indices for one of the table entries opens a second browser page that shows an alignment of the copies against a consensus pattern. The program is very fast, analyzing sequences on the order of .5Mb in just a few seconds. Submitted sequences may be of arbitrary length. Repeats with pattern size in the range from 1 to 2000 bases are detected.
Andra paket besläktade med trf
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
Hämta trf
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 56,9 kbyte | 183,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 4.09.1-6 | 56,9 kbyte | 167,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 4.09.1-6+b1 | 53,5 kbyte | 184,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 4.09.1-6 | 55,4 kbyte | 182,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 4.09.1-6 | 53,0 kbyte | 182,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 54,3 kbyte | 159,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 4.09.1-6 | 55,7 kbyte | 166,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 68,7 kbyte | 231,0 kbyte | [filförteckning] |
| loong64 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 53,0 kbyte | 167,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 51,6 kbyte | 158,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 4.09.1-6 | 55,3 kbyte | 187,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 58,6 kbyte | 183,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 4.09.1-6 | 58,0 kbyte | 183,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 4.09.1-6+b1 | 55,4 kbyte | 148,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 4.09.1-6 | 53,8 kbyte | 163,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 59,4 kbyte | 182,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 53,6 kbyte | 1.080,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 4.09.1-6 | 54,8 kbyte | 154,0 kbyte | [filförteckning] |