Paquet : spoa (4.1.4-2 et autres)

[ Paquet source : spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Autres paquets associés à spoa

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Télécharger spoa

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	4.1.4-2	35,9 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	4.1.4-2+b1	37,4 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	4.1.4-2+b1	36,1 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4.1.4-2+b1	34,7 ko	74,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	4.1.4-2+b1	34,2 ko	62,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	37,4 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
i386	4.1.4-2+b1	37,8 ko	78,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	4.1.4-1	41,3 ko	106,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	36,1 ko	74,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	4.1.4-2+b1	36,2 ko	101,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	36,8 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	4.1.4-2+b1	37,5 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	4.1.4-2+b1	35,9 ko	67,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	4.1.4-2+b1	37,2 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	38,7 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	34,8 ko	1 061,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	4.1.4-2+b1	37,3 ko	78,0 ko	[liste des fichiers]