[ Source: htseq ]
Paketti: python3-htseq (2.0.9+dfsg-1 ja muut)
Links for python3-htseq
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti htseq:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Diane Trout (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [www-huber.embl.de]
Samankaltaisia paketteja:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to study the data quality. * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in a genome browser. * Reading in annotation data from a GFF file. * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and genes.
Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, m68k]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei x32]
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
- dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.14) [ei x32]
- dep: python3 (<< 3.9) [x32]
- dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, sh4]
- dep: python3 (>= 3.13~) [ei m68k, sh4, x32]
- dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
-
- dep: python3-numpy [ei m68k, sh4]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [m68k, sh4]
-
- dep: python3-numpy-abi9 [m68k, sh4]
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
-
- dep: python3-numpy2-abi0 [ei m68k, sh4, x32]
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
- tai python3-numpy-abi9
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Imuroi python3-htseq
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 279.1 kt | 1,243.0 kt | [tiedostoluettelo] |
amd64 | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 313.1 kt | 1,095.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 279.2 kt | 1,111.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 279.8 kt | 1,035.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 285.0 kt | 907.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 312.6 kt | 1,140.0 kt | [tiedostoluettelo] |
loong64 (epävirallinen siirros) | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 298.9 kt | 1,175.0 kt | [tiedostoluettelo] |
m68k (epävirallinen siirros) | 2.0.9+dfsg-1 | 346.6 kt | 1,697.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 256.2 kt | 1,199.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 300.3 kt | 1,303.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 2.0.9+dfsg-1+b2 | 308.3 kt | 903.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sh4 (epävirallinen siirros) | 2.0.9+dfsg-1 | 472.4 kt | 1,691.0 kt | [tiedostoluettelo] |
x32 (epävirallinen siirros) | 0.11.3-1 | 268.1 kt | 816.0 kt | [tiedostoluettelo] |