[ Source: htseq ]
Paketti: python3-htseq (0.13.5-1)
Links for python3-htseq
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti htseq:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Diane Trout (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [www-huber.embl.de]
Samankaltaisia paketteja:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to study the data quality. * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in a genome browser. * Reading in annotation data from a GFF file. * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and genes.
This package contains the Python 3 module.
Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5) [ei armel]
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel]
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Imuroi python3-htseq
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 216.0 kt | 783.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 197.5 kt | 749.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 194.4 kt | 711.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 195.2 kt | 563.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 218.0 kt | 800.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 180.7 kt | 830.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 180.5 kt | 778.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 216.1 kt | 926.0 kt | [tiedostoluettelo] |