Paket: python3-htseq (2.0.5-2 och andra)

[ Källkod: htseq  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

Andra paket besläktade med python3-htseq

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, m68k]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej x32]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ej x32]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [m68k]

  dep: python3 (>= 3.12~) [ej m68k, x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy [x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ej x32]

• dep: python3-numpy-abi9 [ej x32]

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Hämta python3-htseq

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	2.0.5-2+b1	271,7 kbyte	1.238,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	2.0.5-2+b1	301,7 kbyte	1.070,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.0.5-2+b2	272,1 kbyte	1.106,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.0.5-2+b1	268,0 kbyte	986,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.0.5-2+b1	270,9 kbyte	790,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.0.5-2+b1	301,1 kbyte	1.119,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	2.0.5-2	401,3 kbyte	1.652,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.0.5-2+b1	247,4 kbyte	1.193,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.0.5-2+b1	287,9 kbyte	1.234,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.0.5-2+b1	296,1 kbyte	882,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	2.0.5-2+b1	350,5 kbyte	967,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.11.3-1	268,1 kbyte	816,0 kbyte	[filförteckning]