パッケージ: python3-htseq (2.0.5-2 など)

[ ソース: htseq  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

その他の python3-htseq 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, m68k 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [x32 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [x32 以外]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [m68k]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, x32 以外]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy [x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [x32 以外]

• dep: python3-numpy-abi9 [x32 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

python3-htseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.0.5-2+b1	271.7 kB	1,238.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.0.5-2+b1	301.7 kB	1,070.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.0.5-2+b2	272.1 kB	1,106.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.0.5-2+b1	268.0 kB	986.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.0.5-2+b1	270.9 kB	790.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.0.5-2+b1	301.1 kB	1,119.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.0.5-2	401.3 kB	1,652.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.0.5-2+b1	247.4 kB	1,193.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.0.5-2+b1	287.9 kB	1,234.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.0.5-2+b1	296.1 kB	882.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.0.5-2+b1	350.5 kB	967.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.11.3-1	268.1 kB	816.0 kB	[ファイル一覧]