Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: fermi-lite  ]

Paketti: fml-asm (0.1+git20221215.85f159e-1 ja muut)

Links for fml-asm

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti fermi-lite:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Muut pakettiin fml-asm liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Imuroi fml-asm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Versio Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 69.0 kt211.0 kt [tiedostoluettelo]
amd64 0.1+git20221215.85f159e-1 65.6 kt159.0 kt [tiedostoluettelo]
arm64 0.1+git20221215.85f159e-1 61.4 kt147.0 kt [tiedostoluettelo]
armel 0.1+git20221215.85f159e-1 67.0 kt162.0 kt [tiedostoluettelo]
armhf 0.1+git20221215.85f159e-1 66.2 kt118.0 kt [tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 80.9 kt196.0 kt [tiedostoluettelo]
i386 0.1+git20221215.85f159e-1 84.1 kt202.0 kt [tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-1+b1 97.3 kt314.0 kt [tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 69.8 kt162.0 kt [tiedostoluettelo]
mips64el 0.1+git20221215.85f159e-1 69.3 kt219.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 78.2 kt275.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 0.1+git20221215.85f159e-1 75.7 kt211.0 kt [tiedostoluettelo]
riscv64 0.1+git20221215.85f159e-1 71.7 kt131.0 kt [tiedostoluettelo]
s390x 0.1+git20221215.85f159e-1 75.9 kt187.0 kt [tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 91.1 kt210.0 kt [tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 59.3 kt1,044.0 kt [tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros) 0.1+git20221215.85f159e-1 66.0 kt154.0 kt [tiedostoluettelo]