Paketti: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1 ja muut)

[ Source: fermi-lite  ]

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Muut pakettiin fml-asm liittyvät paketit

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  support library providing __atomic built-in functions

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, mipsel]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi fml-asm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66.9 kt	152.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	61.6 kt	148.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.1+git20190320.b499514-1+b1	65.9 kt	159.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66.6 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.1+git20190320.b499514-1+b1	83.4 kt	199.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	69.3 kt	180.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	0.1+git20190320.b499514-1+b1	82.8 kt	203.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	77.1 kt	212.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.1+git20190320.b499514-1+b1	63.2 kt	168.0 kt	[tiedostoluettelo]