Пакунок: fml-asm (0.1+git20221215.85f159e-1 and others)

[ Source: fermi-lite  ]

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Інші пакунки пов'язані з fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  Підтримка бібліотеки, яка забезпечує вбудовані функції __atomic

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Завантажити fml-asm

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	69.0 kB	211.0 kB	[список файлів]
amd64	0.1+git20221215.85f159e-1	65.6 kB	159.0 kB	[список файлів]
arm64	0.1+git20221215.85f159e-1	61.4 kB	147.0 kB	[список файлів]
armel	0.1+git20221215.85f159e-1	67.0 kB	162.0 kB	[список файлів]
armhf	0.1+git20221215.85f159e-1	66.2 kB	118.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	80.9 kB	196.0 kB	[список файлів]
i386	0.1+git20221215.85f159e-1	84.1 kB	202.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	97.3 kB	314.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	69.8 kB	162.0 kB	[список файлів]
mips64el	0.1+git20221215.85f159e-1	69.3 kB	219.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	78.2 kB	275.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0.1+git20221215.85f159e-1	75.7 kB	211.0 kB	[список файлів]
riscv64	0.1+git20221215.85f159e-1	71.7 kB	131.0 kB	[список файлів]
s390x	0.1+git20221215.85f159e-1	75.9 kB	187.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	91.1 kB	210.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	59.3 kB	1,044.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	0.1+git20221215.85f159e-1	66.0 kB	154.0 kB	[список файлів]