Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: fermi-lite  ]

Paketti: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-2~0exp ja muut)

Links for fml-asm

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti fermi-lite:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Muut pakettiin fml-asm liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances
  • dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]
    support library providing __atomic built-in functions
  • dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
  • dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi fml-asm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Versio Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 72.7 kt211.0 kt [tiedostoluettelo]
amd64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.0 kt155.0 kt [tiedostoluettelo]
arm64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 59.3 kt147.0 kt [tiedostoluettelo]
armel 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.9 kt158.0 kt [tiedostoluettelo]
armhf 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.2 kt118.0 kt [tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 81.2 kt196.0 kt [tiedostoluettelo]
i386 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 84.5 kt198.0 kt [tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 95.7 kt311.0 kt [tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 70.0 kt162.0 kt [tiedostoluettelo]
mips64el 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 68.8 kt219.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 78.7 kt275.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 76.5 kt211.0 kt [tiedostoluettelo]
riscv64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp+b1 72.4 kt132.0 kt [tiedostoluettelo]
s390x 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 63.0 kt167.0 kt [tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 91.4 kt210.0 kt [tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 59.8 kt1,044.0 kt [tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.0 kt150.0 kt [tiedostoluettelo]