Paketti: autodock-vina (1.1.2-6 ja muut)

[ Source: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

Muut pakettiin autodock-vina liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ei armel, armhf]

• sug: autodock

  analysis of ligand binding to protein structure

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Imuroi autodock-vina

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.1.2-6+b1	233.0 kt	598.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1.2-6+b1	208.8 kt	542.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1.2-6+b1	209.3 kt	536.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1.2-6+b1	204.0 kt	408.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1.2-6+b1	236.9 kt	596.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1.2-6+b1	210.4 kt	657.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1.1.2-6+b1	213.7 kt	641.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1.2-6+b1	234.0 kt	726.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1.2-6+b1	207.3 kt	578.0 kt	[tiedostoluettelo]