Paketti: autodock-vina (1.2.3-2)

[ Source: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

Muut pakettiin autodock-vina liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.33)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ei armel, armhf, mipsel]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• sug: autodock

  analysis of ligand binding to protein structure

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Imuroi autodock-vina

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	254.6 kt	685.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	229.3 kt	621.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	223.7 kt	599.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	219.4 kt	459.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	262.2 kt	683.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	228.5 kt	734.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	234.7 kt	722.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	262.2 kt	853.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	227.1 kt	661.0 kt	[tiedostoluettelo]