Balík: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-2~0exp a iné)

[ Zdroj: fermi-lite  ]

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť fml-asm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	72.7 kB	211.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	66.0 kB	155.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	59.3 kB	147.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	66.9 kB	158.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	66.2 kB	118.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	81.2 kB	196.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	84.5 kB	198.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	95.7 kB	311.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	70.0 kB	162.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	68.8 kB	219.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	78.7 kB	275.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	76.5 kB	211.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.1+git20190320.b499514-2~0exp+b1	72.4 kB	132.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	63.0 kB	167.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	91.4 kB	210.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	59.8 kB	1,044.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.1+git20190320.b499514-2~0exp	66.0 kB	150.0 kB	[zoznam súborov]