Paket: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1 och andra)

[ Källkod: fermi-lite  ]

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Andra paket besläktade med fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  support library providing __atomic built-in functions

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, mipsel]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta fml-asm

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66,9 kbyte	152,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	61,6 kbyte	148,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.1+git20190320.b499514-1+b1	65,9 kbyte	159,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66,6 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.1+git20190320.b499514-1+b1	83,4 kbyte	199,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	69,3 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	0.1+git20190320.b499514-1+b1	82,8 kbyte	203,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	77,1 kbyte	212,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.1+git20190320.b499514-1+b1	63,2 kbyte	168,0 kbyte	[filförteckning]