Paketti: freebayes (1.3.5-1)

[ Source: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ei armel, armhf]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Imuroi freebayes

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,433.4 kt	3,949.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,385.5 kt	3,805.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1,367.9 kt	3,789.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1,377.7 kt	3,417.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1,480.3 kt	4,153.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1,420.4 kt	4,291.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1,444.5 kt	4,292.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1,452.5 kt	4,254.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1,366.8 kt	4,028.0 kt	[tiedostoluettelo]