Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-10)

[ Source: tree-puzzle  ]

Reconstrucción de árboles filogenéticos por máximas probabilidades

TREE-PUZZLE (el nuevo nombre de PUZZLE) es un programa de consola interactivo que implementa un algoritmo de búsqueda rápida en árbol, dividiendo en cuartetos, que permite el análisis de grandes conjuntos de datos y les asigna automáticamente estimaciones de soporte de cada rama interna. TREE-PUZZLE también calcula las distancias de probabilidad máxima por parejas así como las longitudes de las ramas para los árboles que especifique el usuario. Las longitudes de las ramas también se pueden calcular bajo el uso del reloj. Además, TREE-PUZZLE ofrece un método nuevo, el mapeado de probabilidad, para investigar el soporte de ramas internas hipotéticas sin calcular todo el árbol y para ver el contenido filogenético de una alineación de secuencia.

Esta es la versión paralelizada de tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

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