Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-10)

[ Source: tree-puzzle  ]

Paralleliseret rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed

TREE-PUZZLE (det nye navn for PUZZLE) er et interaktivt konsolprogram, der implementerer en hurtig algoritme for træ-søgning, kvartets-gåder (»quartet-puzzling«), der tillader analyse af større datasæt og automatisk tildeling af estimater af understøttelse for hver enkelt interne gren. TREE-PUZZLE beregner også parvist sandsynligheden for maksimale distancer, og desuden længden på grene for træer angivet af bruger. Længde på grene kan også beregnes med antagelsen af et ur (»clock-assumption«). Yderligere tilbyder TREE-PUZZLE en ny metode, ligheds-kortlægning, til at undersøge understøttelsen af hypotese-baserede interne grene uden beregning af træet i sin helhed, samt visualisering af det fylogenetistiske indhold af sekvensjusteringer.

Dette er den paralleliserede version af tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: openmpi-bin

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - binære filer

• rec: tree-puzzle-doc

  Rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed - dok.

• sug: phylip

  Programpakke for udledning af fylogenier

• sug: treetool

  Package not available

Download tree-ppuzzle

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	196.2 kB	543.0 kB	[list of files]