Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-12 und andere)

[ Quellcode: hmmer2  ]

Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.

Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-12)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

hmmer2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	312,1 kB	2.527,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.3.2+dfsg-12+b2	306,5 kB	2.178,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.3.2+dfsg-12+b2	282,1 kB	2.389,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.3.2+dfsg-12+b2	270,1 kB	2.384,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.3.2+dfsg-12+b2	268,1 kB	1.808,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	292,9 kB	2.179,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.3.2+dfsg-12+b2	313,5 kB	2.492,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12	335,7 kB	3.968,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	295,6 kB	2.387,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	284,0 kB	1.925,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.3.2+dfsg-12+b2	307,8 kB	2.462,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	308,7 kB	2.966,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.3.2+dfsg-12+b2	308,9 kB	2.902,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.3.2+dfsg-12+b2	304,2 kB	1.861,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.3.2+dfsg-12+b2	302,1 kB	2.319,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	292,0 kB	2.195,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	272,5 kB	9.908,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.3.2+dfsg-12+b2	305,8 kB	2.120,0 kB	[Liste der Dateien]