Paket: biosquid (1.9g+cvs20050121-15.1 und andere)

[ Quellcode: biosquid  ]

Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse

SQUID ist eine Bibliothek von C-Code-Funktionen für die Sequenzanalyse. Sie enthält auch eine Reihe von kleinen Hilfswerkzeugen, um Sequenzdateien zu konvertieren, Statistiken anzuzeigen, diese zu manipulieren und andere Funktionen auf sie anzuwenden.

Ursprünglich war der Paketname »squid«, da jedoch bereits ein Paket namens »squid« im Archiv vorhanden war (ein Proxy-Cache), wurde es auf »biosquid« umbenannt.

Dieses Paket enthält einige Werkzeuge, welche die Möglichkeiten der Bibliothek demonstrieren.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, use::converting, Bearbeiten, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with::TODO

Andere Pakete mit Bezug zu biosquid

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsquid1t64 (= 1.9g+cvs20050121-15.1) [alpha, ia64]

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

  dep: libsquid1t64 (= 1.9g+cvs20050121-15.1+b1) [nicht alpha, ia64]

• rec: hmmer

  Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

biosquid herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1	77,2 kB	922,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	77,8 kB	366,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	74,0 kB	919,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	71,5 kB	302,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	68,8 kB	231,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	71,5 kB	264,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	77,4 kB	343,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1	87,8 kB	439,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	71,8 kB	269,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	75,1 kB	938,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	81,9 kB	922,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	83,1 kB	922,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	75,3 kB	292,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	78,8 kB	335,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	78,4 kB	911,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	76,0 kB	13.415,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	76,7 kB	333,0 kB	[Liste der Dateien]