Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)

[ Quellcode: hmmer2  ]

Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.

Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht arm64]

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - Shared Libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

• sug: hmmer2-pvm (>= 2.3.2+dfsg-6)

  HMMER mit Unterstützung für PVM (Parallel Virtual Machine)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.614,9 kB	3.147,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.538,0 kB	2.953,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.510,6 kB	2.484,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.549,3 kB	3.382,0 kB	[Liste der Dateien]