パッケージ: hmmer2 (2.3.2+dfsg-12 など)

[ ソース: hmmer2  ]

タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル

HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。

入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ　(相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。

その他の hmmer2 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-12)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

hmmer2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12	310.8 kB	2,462.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.3.2+dfsg-12+b1	306.4 kB	2,174.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.3.2+dfsg-12+b1	281.1 kB	2,389.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.3.2+dfsg-12+b1	270.7 kB	2,048.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.3.2+dfsg-12+b1	268.4 kB	1,612.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	293.4 kB	2,179.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.3.2+dfsg-12+b1	313.4 kB	2,492.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12	335.7 kB	3,968.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	284.4 kB	1,925.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.3.2+dfsg-12+b1	304.6 kB	2,462.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	308.5 kB	2,966.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.3.2+dfsg-12+b1	308.2 kB	2,902.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.3.2+dfsg-12+b1	303.6 kB	1,857.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.3.2+dfsg-12+b1	301.9 kB	2,319.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	292.2 kB	2,195.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	272.1 kB	9,908.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.3.2+dfsg-12+b1	305.6 kB	2,120.0 kB	[ファイル一覧]