Paket: cassiopee (1.0.9-4 und andere)

[ Quellcode: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Andere Pakete mit Bezug zu cassiopee

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Serialisierungsbibliothek für C++

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, arm64, ia64, loong64, sh4, x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgoogle-glog0v6t64 (>= 0.6.0)

  Bibliothek, die auf der Anwendungsebene protokolliert

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

cassiopee herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	16,6 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.0.9-4+b1	17,2 kB	71,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0.9-4+b2	16,6 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0.9-4+b1	15,8 kB	57,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0.9-4+b1	15,6 kB	53,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	16,6 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0.9-4+b1	17,7 kB	65,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	19,0 kB	76,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	16,4 kB	75,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	16,8 kB	57,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0.9-4+b1	17,1 kB	157,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	17,4 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0.9-4+b1	17,5 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0.9-4+b1	16,5 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0.9-4+b1	16,5 kB	63,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	17,9 kB	153,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b1	16,4 kB	2.077,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.0.9-4+b2	17,1 kB	61,0 kB	[Liste der Dateien]