Paket: cassiopee (1.0.9-4 und andere)

[ Quellcode: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Andere Pakete mit Bezug zu cassiopee

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgoogle-glog0v6t64 (>= 0.6.0)

  Bibliothek, die auf der Anwendungsebene protokolliert

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

cassiopee herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.0.9-4+b1	17,2 kB	71,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0.9-4+b2	16,6 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0.9-4+b1	15,8 kB	57,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0.9-4+b1	15,6 kB	53,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0.9-4+b1	17,7 kB	65,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0.9-4+b1	17,1 kB	157,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0.9-4+b1	17,5 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0.9-4+b1	16,5 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0.9-4+b1	16,5 kB	63,0 kB	[Liste der Dateien]