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index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

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硬件架构 版本 软件包大小 安装后大小 文件
alpha (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 16.6 kB155.0 kB [文件列表]
amd64 1.0.9-4+b1 17.2 kB71.0 kB [文件列表]
arm64 1.0.9-4+b2 16.6 kB155.0 kB [文件列表]
armel 1.0.9-4+b1 15.8 kB57.0 kB [文件列表]
armhf 1.0.9-4+b1 15.6 kB53.0 kB [文件列表]
hppa (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 16.6 kB59.0 kB [文件列表]
i386 1.0.9-4+b1 17.7 kB65.0 kB [文件列表]
ia64 (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 19.0 kB76.0 kB [文件列表]
m68k (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 16.8 kB57.0 kB [文件列表]
mips64el 1.0.9-4+b1 17.1 kB157.0 kB [文件列表]
ppc64 (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 17.4 kB155.0 kB [文件列表]
ppc64el 1.0.9-4+b1 17.5 kB155.0 kB [文件列表]
riscv64 1.0.9-4+b1 16.5 kB59.0 kB [文件列表]
s390x 1.0.9-4+b1 16.5 kB63.0 kB [文件列表]
sh4 (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 17.9 kB153.0 kB [文件列表]
sparc64 (非官方移植版) 1.0.9-4+b1 16.4 kB2,077.0 kB [文件列表]
x32 (非官方移植版) 1.0.9-4+b2 17.1 kB61.0 kB [文件列表]