Package: unifrac-tools (1.4-3 and others)
Links for unifrac-tools
Debian Resources:
Download Source Package unifrac-tools:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger - binære filer
De facto-arkivet for højtydende fylogenetiske mangfoldighedsberegninger. Metoderne i dette arkiv er baseret på en implementering af Strided State UniFrac-algoritmen der er hurtigere, og bruger mindre hukommelse end Fast UniFrac. Strided State UniFrac understøtter Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac og meta UniFrac. Dette arkiver indeholder også Stacked Faith (manuskript under forberedelse), en metode til at beregne Faith's PD, der er hurtigere og bruger mindre hukommelse end den Fast UniFrac-baserede referenceimplementering.
Denne pakke indeholder de binære filer ssu og faithpd for målet.
Other Packages Related to unifrac-tools
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)
- nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 11) [arm64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 12) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: liblapacke (>= 3.12.0)
- Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - C lib-delt version
-
- dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)
- Hurtigt LZ-komprimeringsalgoritmebibliotek - kørselstid
-
- dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker
-
- dep: libssu0
- Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger - bibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libsz2 (>= 1.1.3)
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download unifrac-tools
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1.4-3+b4 | 1,738.8 kB | 8,540.0 kB | [list of files] |
arm64 | 1.4-3+b4 | 1,506.4 kB | 9,077.0 kB | [list of files] |
armel | 1.4-3+b4 | 1,555.5 kB | 9,556.0 kB | [list of files] |
armhf | 1.4-3+b4 | 1,519.9 kB | 6,504.0 kB | [list of files] |
i386 | 1.4-3+b4 | 1,646.3 kB | 10,274.0 kB | [list of files] |
mips64el | 1.4-3+b4 | 1,347.0 kB | 9,510.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 1.4-3+b4 | 1,509.5 kB | 10,356.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 1.4-3+b4 | 1,824.5 kB | 7,629.0 kB | [list of files] |