Balík: unifrac-tools (1.4-3 a iné)

[ Zdroj: unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Ostatné balíky súvisiace s balíkom unifrac-tools

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)

• dep: libgcc-s1 (>= 11) [arm64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 12) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  knižnica rýchleho komprimačného algoritmu LZ - dynamická knižnica

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libsz2 (>= 1.1.3)

  knižnica Adaptive Entropy Coding - SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť unifrac-tools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.4-3+b4	1,738.8 kB	8,540.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.4-3+b4	1,506.4 kB	9,077.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.4-3+b4	1,555.5 kB	9,556.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.4-3+b4	1,519.9 kB	6,504.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.4-3+b4	1,646.3 kB	10,274.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.4-3+b4	1,347.0 kB	9,510.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.4-3+b4	1,509.5 kB	10,356.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.4-3+b4	1,824.5 kB	7,629.0 kB	[zoznam súborov]