Pakiet: unifrac-tools (1.4-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Inne pakiety związane z unifrac-tools

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  Biblioteka szybkiego algorytmu kompresji LZ - uruchomieniowa

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libsz2 (>= 1.1.3)

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie unifrac-tools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.4-3+b2	1 630,4 KiB	7 938,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.4-3+b2	1 407,7 KiB	8 574,0 KiB	[lista plików]
armel	1.4-3+b2	1 488,8 KiB	9 361,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.4-3+b2	1 433,5 KiB	6 258,0 KiB	[lista plików]
i386	1.4-3+b2	1 488,4 KiB	9 868,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.4-3+b2	1 175,9 KiB	8 790,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.4-3+b2	1 398,9 KiB	10 110,0 KiB	[lista plików]