Package: r-bioc-variantannotation (1.50.0-1)

[ Source: r-bioc-variantannotation  ]

BioConductor-annotation af genetiske varianter

Denne BioConductor-pakke tilbyder R-funktioner til at annotere varianter, beregne ændring af aminosyrekodning og forudsige kodningsresultater.

Other Packages Related to r-bioc-variantannotation

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4-genriske summeringsstatistikfunktioner der fungerer på matrix-lignende objekter

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 3.0.0)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-dbi

  GNU R-pakke der tilbyder en generisk databasegrænseflade

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-annotationhub (>= 3.12.0)

  GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-snpstats (>= 1.54.0)

  BioCondutor - SnpMatrix- og XSnpMatrix-klasser og metoder

• sug: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• sug: r-cran-httr

  GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-magick

  advanced graphics and image-processing in GNU R

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-variantannotation

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,425.5 kB	6,760.0 kB	[list of files]
arm64	3,408.1 kB	6,776.0 kB	[list of files]
mips64el	3,398.1 kB	6,878.0 kB	[list of files]
ppc64el	3,459.2 kB	7,032.0 kB	[list of files]
riscv64	3,437.7 kB	6,612.0 kB	[list of files]
s390x	3,440.0 kB	6,860.0 kB	[list of files]