Package: r-bioc-genomeinfodb (1.40.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-genomeinfodb  ]

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

Denne pakke indeholder BioConductor-redskaber til at manipulere kromosom og andre »seqname«-identifikatorer.

Pakken Seqnames indeholder data og funktioner, der definerer og tillader oversættelse mellem forskellige kromosomsekvensnavnekonventioner (f.eks. »chr1« versus »1«), inklusive en funktion der forsøger at placere sekvensnavne i deres naturlige, frem for deres leksikografiske, rækkefølge.

Other Packages Related to r-bioc-genomeinfodb

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodbdata (>= 1.2.12)

  BioConductor - opslagstabeller for art og taksonomi-id

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-ucsc.utils (>> 1.0.0+ds-1)

  Low-level utilities to retrieve data from the UCSC Genome

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• sug: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-cran-data.table

  GNU R-udvidelse af Data.frame

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-r.utils

  GNU R - diverse programmeringsredskaber

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-genomeinfodb

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,753.2 kB	5,027.0 kB	[list of files]