Pakiet: dnaclust (3-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Znaczniki: Biologia: Fasta/Pearson, Kwasy nukleinowe, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: C++, Rola: role::program, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z dnaclust

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

Pobieranie dnaclust

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	3-7+b3	111,9 KiB	681,0 KiB	[lista plików]
arm64	3-7+b4	105,2 KiB	733,0 KiB	[lista plików]
armel	3-7+b3	101,5 KiB	646,0 KiB	[lista plików]
armhf	3-7+b3	101,2 KiB	582,0 KiB	[lista plików]
i386	3-7+b3	115,6 KiB	678,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3-7+b3	112,2 KiB	880,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3-7+b3	114,6 KiB	861,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3-7+b1	108,9 KiB	629,0 KiB	[lista plików]
s390x	3-7+b3	115,3 KiB	701,0 KiB	[lista plików]