Package: r-bioc-variantannotation (1.28.10-1) [debports]

[ Source:  ]

BioConductor-annotation af genetiske varianter

Denne BioConductor-pakke tilbyder R-funktioner til at annotere varianter, beregne ændring af aminosyrekodning og forudsige kodningsresultater.

Other Packages Related to r-bioc-variantannotation

• dep: libc6 (>= 2.15)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-3.5

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.8

  Package not available

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.33.6)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.24)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.9)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-dbi

  GNU R-pakke der tilbyder en generisk databasegrænseflade

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• rec: r-bioc-snpstats

  BioCondutor - SnpMatrix- og XSnpMatrix-klasser og metoder

• rec: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

• sug: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

Download r-bioc-variantannotation

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	2,919.0 kB	4,040.0 kB	[list of files]