Package: r-bioc-variantannotation (1.28.10-1) [debports]

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annotazione di varianti genetiche per BioConductor

Questo pacchetto per BioConductor fornisce funzioni R per annotare varianti, calcolare cambiamenti nella codifica degli aminoacidi e prevedere i risultati delle codifiche.

Other Packages Related to r-bioc-variantannotation

• dep: libc6 (>= 2.15)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-3.5

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.8

  Package not available

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

  GNU R Annotation Database Interface per BioConductor

• dep: r-bioc-biobase

  funzioni base per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.33.6)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.24)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.9)

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi

  pacchetto GNU R che fornisce un'interfaccia generica per database

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• rec: r-bioc-snpstats

  classi e metodi SnpMatrix e XSnpMatrix per BioConductor

• rec: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

• sug: r-bioc-annotationhub

  client GNU R per accedere a risorse AnnotationHug

• sug: r-cran-ggplot2

  implementazione di Grammar of Graphics

Download r-bioc-variantannotation

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	2,919.0 kB	4,040.0 kB	[list of files]