Package: r-cran-alakazam (0.3.0-1) [debports]

[ Source:  ]

Immunoglobulin Clonal Lineage og Diversity Analysis

Alakazam er en del af Immcantation-analyserammen for Adaptive Immune Receptor Repertoire-sekventering (AIRR-seq) og tilbyder et sæt af værktøjer til at undersøge lymfocytreceptor klonale linjer, diversitet, genbrug og andre repertoire-niveauegenskaber med fokus på høj-gennemløb immunoglobulin -sekventering (Ig).

Alakazam har fem hovedformål:

 * Tilbyder grundlæggende funktionalitet for andre R-pakker i rammen
   Immcantation. Dette inkluderer gængse opgaver såsom fil-I/O,
   grundlæggende DNA-sekvensmanipulering og interaktion med V(D)J-segment
   og genannoationer
 * Tilbyder en R-grænseflade til interaktion med resultatet af pRESTO- og
   Change-O-værktøjspakkerne
 * Udfører afstamningsrekonstruktion på klonale populationer af Ig-
   sekvenser og analyserer topologien af ​​de resulterende afstamningstræer
 * Udførelse af klonal overflods- og diversitetsanalyse på lymfocyt-
   repertoirer
 * Udførelse af fysisk-kemiske egenskabsanalyser af lymfocytreceptor-
   sekvenser

Other Packages Related to r-cran-alakazam

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1)

  Package not available

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-3.5

  Package not available

• dep: r-base-core (>= 3.6.1-2)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

Download r-cran-alakazam

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
m68k (unofficial port)	1,706.4 kB	2,053.0 kB	[list of files]