Package: libbio-samtools-perl (1.43-5 and others)

[ Source: libbio-samtools-perl  ]

Perlgrænseflade til SamTools-biblioteket for DNA-sekventering

Bio::SamTools tilbyder en Perlgrænseflade til biblioteket libbam for indekseret og ikke indekseret SAM/BAM-sekvenssammenligningsdatabaser. Det tilbyder understøttelse for indhentelse af information på individuelle sammenligninger, læser par, og information om sammenligningsdækning på tværs af store regioner. Det tilbyder også tilbagekaldsfunktionalitet for kald af SNP'er og udførelse af andre base til base-funktioner. De fleste operationer er kompatible med BioPerl Bio::SeqFeatureI-grænsefladen, der tillader, at BAM-filer kan bruges som en motor til GBrowse-genombrowserprogrammet.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library, Shared Library

Other Packages Related to libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - grundlæggende Perlmoduler

• dep: libc6 (>= 2.15) [sparc64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: perl (>= 5.22.1-7) [sparc64]

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

  dep: perl (>= 5.40.0-6) [not ia64, sparc64]

• dep: perlapi-5.22.1 [sparc64]

  Package not available

• dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

  virtual package provided by perl-base

• dep: perlapi-5.40.0 [not ia64, sparc64]

  virtual package provided by perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download libbio-samtools-perl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.43-5+b1	182.1 kB	746.0 kB	[list of files]
amd64	1.43-5+b1	177.2 kB	587.0 kB	[list of files]
arm64	1.43-5+b1	166.2 kB	615.0 kB	[list of files]
armel	1.43-5+b1	162.1 kB	549.0 kB	[list of files]
armhf	1.43-5+b1	161.3 kB	449.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.43-5+b1	176.8 kB	632.0 kB	[list of files]
i386	1.43-5+b1	187.4 kB	621.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.43-5	206.8 kB	990.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.43-5+b1	163.0 kB	541.0 kB	[list of files]
mips64el	1.43-5+b1	165.3 kB	699.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.43-5+b1	182.6 kB	743.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.43-5+b1	184.7 kB	743.0 kB	[list of files]
riscv64	1.43-5+b1	179.4 kB	527.0 kB	[list of files]
s390x	1.43-5+b1	171.4 kB	607.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.43-5+b1	181.0 kB	614.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.43-1	174.3 kB	616.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.43-5+b1	177.5 kB	569.0 kB	[list of files]