Package: ipig (0.0.r5-5 and others)

[ Source: ipig  ]

Integrering af PSM'er til arvemassebrowservisualiseringer

iPiG er målrettet integrationen af peptide spektrummatchninger (PSM'er) fra massespektrometri (MS) peptide identifikationer til arvemassevisualisationer tilbudt af arvemasebrowsere såsom UCSC-arvemassebrowseren (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG anvender PSM'er fra MS-standardformatet mzIdnetML (*.mzid) eller i tekstformat og tilbyder resultater i arvemasssesporformater (BED- eller GFF3-filer), som nemt kan importeres ind i arvemassebrowsere.

Other Packages Related to ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for arbejde med komprimerings- og arkivformater

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Javklient-API for grundlæggende internetprotokoller

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  Validering af XML-fortolker for Java med understøttelse på DOM niveau 3

Download ipig

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
amd64	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
arm64	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
armel	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
armhf	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
i386	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.0.r5-4	160.9 kB	186.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.0.r5-5	162.6 kB	188.0 kB	[list of files]
mips64el	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
riscv64	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
s390x	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.0.r5-5	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]